Föremålet närmade sig gränsen från den vitryska sidan på tisdagen och korsade den i Kraslava-regionen. Försvarsministeriet i Riga hade tidigare rapporterat att ett oidentifierat flygande föremål hade setts.
Natos stridsflygplan på Lielvarde-basen skickades ut för att övervaka luftrummet, men lyckades inte upptäcka några misstänkta föremål.
Lettland har inte egna stridsflygplan, i likhet med sina NATO-grannar Estland och Litauen vid Östersjön. Sedan 2004 har det baltiska luftrummet skyddats av andra NATO-medlemmar på rotationsbasis.
För närvarande är det tyska Luftwaffe som utför detta uppdrag, med ett antal Eurofighters i tjänst i Lielvarde.
Beslutet att lyfta Natos stridsflygplan fattades eftersom man inte visste vilken typ av flygande föremål det rörde sig om, sade försvarsminister Andris Sprūds till reportrar efter ett regeringssammanträde.
Han påpekade att Lettland delar gräns med Ryssland och står inför hotet om hybridkrigföring.
Den 7 september flög en rysk drönare in i Lettland från Vitryssland och kraschade 90 km från gränsen nära staden Rezekne i närheten av Gaigalava.
Enligt den lettiska armén var den utrustad med en sprängladdning, som desarmerades när drönaren hittades.
