En 59-årig man och en 77-årig kvinna dog, uppger polis och brandmän för Elta.
Enligt Edita Zdanevičienė, representant för PRT, rapporterades kl. 05.02 att lågor slog ut från en lägenhet i ett femvåningshus på Gardino Street i Šiauliai.
Branden bröt ut i en trerumslägenhet på första våningen.
När brandmännen gick in i lägenheten fann de två personer, en kvinna på balkongen och en man i ett rum. Brandmännen överlämnade dem till sjukvårdspersonalen som omedelbart påbörjade återupplivning, men deras liv gick inte att rädda.
De andra boende i huset gick ut och cirka 15 personer fördes bort av poliser.
Elden brände köket och korridoren, brände väggarna i ett rum och taket och väggarna i ett annat.
Klockan 17.40 var branden redan släckt och tre brandbilar hade skickats ut för att släcka den.
Enligt PRT:s uppgifter omkom under årets första tio månader 18 personer på grund av vårdslös hantering av eld, 16 personer på grund av vårdslös rökning, 6 personer på grund av brott mot kraven för installation och drift av spisar, eldstäder och skorstenar och 6 personer på grund av fel på elektrisk utrustning och apparater, 3 på grund av en extern brandkälla, 2 på grund av explosioner, 1 på grund av överträdelser av reglerna för installation och drift av elektrisk utrustning, 1 på grund av avsiktliga handlingar av människor (mordbrand), 1 på grund av haverier i gas-, fotogen-, bensinapparater och anordningar och av andra skäl.
Dödsorsakerna för tolv andra håller på att klarläggas.
Hittills i år har 71 personer dödats och 159 skadats i bränder i landet.