Enligt henne hittades flygdata och samtalsloggar från cockpit (svarta lådor) omkring kl. 11.30 och avlägsnades från vraket.
En 48-årig spansk medborgare dödades och en annan spanjor, samt en tysk och en litauisk, skadades när ett DHL-flygplan med fyra personer ombord kraschade nära Vilnius flygplats på måndagsmorgonen. En av dem är i allvarligt tillstånd.
Planet träffade också ett hus med 13 personer ombord, som alla lyckades fly.
Efter olyckan inledde justitieministeriets avdelning för utredning av transportolyckor och incidenter en säkerhetsutredning. Syftet är att förhindra framtida olyckor.
Enligt ministeriet är säkerhetsutredningen inte avsedd att fastställa vem som bär skulden eller ansvaret. En säkerhetsutredning är oberoende av, har inget samband med och påverkas inte av rättsliga eller administrativa förfaranden för att fastställa vem som har begått fel eller är ansvarig.
Utredningen av DHL:s fraktflygplan som kraschade i Vilnius ska vara klar inom tre dagar, varefter flygplanet ska avlägsnas från platsen.
Hittills har minst 19 vittnen intervjuats i samband med olyckan.
Det är ännu oklart vad som orsakade kraschen av fraktplanet och det går inte att utesluta sabotage eller terroristhandlingar.
Polisen har talat med besättningen på det flygplan som kraschade i Vilnius på måndagen, men de har inte antytt att en brand bröt ut ombord på flygplanet innan det slog i marken, säger tjänstemän.
Den kraschade Boeing 737 ägdes av det spanska flygbolaget Swift Air och användes av DHL för att transportera paket. Flygplanet flög från Leipzig i Tyskland.
