109 brandmän och 38 utrustningar arbetar på platsen, enligt den tillförordnade guvernören i regionen, Yuri Sliusar.
Telegramkanaler bekräftade att branden bröt ut vid Atlas oljeraffinaderi nära gränsen till Luhansk oblast.
Trots brandens omfattning rapporterades inga dödsoffer.
De lokala myndigheterna rapporterade också att omkring 30 obemannade flygfarkoster (UAV) skjutits ned över området.
Det ryska försvarsministeriet rapporterade att 47 ukrainska UAV:er förstördes under natten, varav 29 förstördes över Rostov-regionen.
Atlas Oil Base har sedan starten specialiserat sig på lagring och transport av oljeprodukter.
Enligt lokala medier levererar företaget bränsle till den ryska armén.
Under 2020 var Atlas värd för övningen Kavkaz-2020 som organiserades av det ryska försvarsministeriet och Rosreserve.
I övningen ingick utbildning i hur man transporterar bränsle på väg, järnväg och i rörledning.
Rostovregionen har upprepade gånger varit måltavla för drönare.
Atlas-incidenten inträffade vid en tidpunkt då antalet flyganfall mot strategiska platser ökar, vilket indikerar en växande inbromsning i gränsområdena.
Tjänstemän och experter noterar att en drönarattack kan rikta sig mot objekt som är viktiga för den ryska militärens säkerhet.
https: cursorinfo.co.il