Helikopterpiloten var enligt uppgift tvungen att nödlanda. Det är dock oklart om statschefen faktiskt flög helikoptern.
”Enligt obekräftade uppgifter har helikoptern med president Raisi varit inblandad i en olycka i provinsen Östra Azerbajdzjan”, rapporterade den statliga televisionen.
En räddningsinsats uppges vara på gång, men räddningsteamen har svårt att ta sig fram på grund av dåliga väderförhållanden och tjock dimma.
Enligt lokala medier kan Irans utrikesminister Hossein Amir-Abdollahian och lokala myndigheter ha flugit i samma helikopter.
E. Raisi besökte provinsen Östra Azerbajdzjan i nordvästra Iran på söndagen och invigde ett dammprojekt på gränsen mellan de två länderna tillsammans med Azerbajdzjans president Ilham Aliyev.
Raisi, 63, blev Irans president i juni 2021.