Domstolen slog fast att Bikulčienė, med hjälp av affärsmannen Antanas Petrošius, hade missbrukat sin officiella ställning, vilket orsakat allvarlig skada för staten och NCC.
Hon dömdes till böter på 33,6 tusen euro.
Domstolen biföll också delvis NKC:s civilrättsliga yrkande och förpliktade Bikulčienė att betala 20 000 EUR i ideellt skadestånd.
Domstolen dömde också Petrošius. Han befanns skyldig till medhjälp och dömdes till böter om 22 200 EUR.
Båda de dömda personerna ska betala 5 000 euro vardera till NCC för advokattjänster.
Domen kan överklagas till appellationsdomstolen inom 20 dagar.
Förundersökningen i detta ärende inleddes i mars 2018 av Special Investigation Service.
Åklagarmyndigheten har tidigare meddelat att de uppgifter som samlats in under utredningen ger anledning att tro att den tidigare chefen för NKC kan ha kommit överens med A. Petrošius, aktieägare i Solis Tribus, för att skapa exklusiva villkor för bolagets verksamhet.
Bikulčienė avgick från sin befattning som chef för Nationella blodcentralen i april 2018 efter anklagelser om korruption, som hon förnekade.
Redan 2018 sade hon att anklagelserna om att ha försökt hjälpa det litauiska företaget Solis Tribus att monopolisera insamlingen av blodplasma och leveransen av blodprodukter i Litauen uppdagades efter att en konkurrent, Octapharmas representant i Lettland, Aleksandrs Cesas, kontaktat litauiska myndigheter, inklusive hälsoministeriet.
Bikulčienė hänförde alla brottsbekämpande åtgärder vid den tidpunkten till det lettiska företagets försök att eliminera konkurrenter.
